独自ドメイン取得の件は以前にも書いたんですが、個別記事URL、アーカイブ、トラックバックURL等以前のアドレスのままだったので、なんとかできないかとちょこちょこ調べていました。でもマニュアル、ヘルプにもどこにも書いてないし。。。再構築できないの？と諦めようかと。
ヤプログのカスタマーサポートに問い合わせもして見たんですが、質問の仕方が悪かったのかよく分かりませんでした（それにしても、返答は遅かったよ）

が、しかし。解決しました。

今日管理画面の設定＞ヤプ！マイアドレス設定 ＞サブドメイン設定＞トラックバック元URL他設定という項目が！これで各種URL(トラックバック、RSS）を、独自ドメインで生成できました。
でもあれー？前からあったっけ？


マニュアルのヤプ！マイアドレスについてによると

魚拓
となっていてトラックバック元URL他設定は見あたらない。多分一昨日のメンテナンスで追加されたんだと思われます。
多分そのうち告知されるんだとは思いますが、いつも事後報告なんですよね。しかもこれは有料サービスなんだからもうちょっと親切でもいいかと。他社の同様のサービスと比べても割高だしｗまあ今後の改善を期待します。